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tcga论文权威发布_tcga数据库r包下载(2024年12月精准访谈)

内容来源：这家有保障所属栏目：观点更新日期：2024-12-02

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2024年10月，中山大学肖振东独立通讯在Hepatology （IF=12.9）在线发表题为“Pseudouridine synthase 1 promotes hepatocellular carcinoma through mRNA pseudouridylation to enhance the translation of oncogenic mRNAs”的研究论文。该研究通过分析TCGA数据集，发现PUS1在人类HCC标本中显著上调，并与肿瘤等级和HCC的不良预后呈正相关。 PUS1的敲低抑制了细胞增殖并减少了皮下异种移植小鼠模型中的肿瘤生长。相应地，在PUS1过表达的细胞中，观察到细胞增殖和肿瘤生长显著增加。此外，PUS1过表达显著加速了通过动态尾静脉注射建立的小鼠HCC模型中的肿瘤形成，而PUS1的敲除则减少了肿瘤形成。此外，PUS1的催化活性对于HCC肿瘤发生是必需的。在机制方面，作者通过利用载脂蛋白B mRNA编辑酶1（APOBEC1）介导的分析方法，确定了PUS1的mRNA靶标，发现PUS1将假尿苷引入一组癌基因的mRNA中，从而增强了这些mRNA的翻译能力。作者的研究突出了PUS1和假尿苷化在HCC发展中的关键作用，并提供了新的见解，即PUS1通过假尿苷化介导的mRNA翻译，增强了一组癌基因（包括胰岛素受体底物1（IRS1）和c-MYC）的蛋白质水平。「iNature」

科研型医生：如何在医学领域脱颖而出？在医院的众多医生中，有一些人凭借着独特的人格魅力脱颖而出。他们或是雷厉风行的女主任，或是低调的主治医生，还有那些年轻有为的青年副高，被称为“科研型医生”。 𐟌Ÿ 什么是科研型医生？科研型医生不仅仅是临床工作的能手，还要具备科研思维和能力。他们不是单一从事科研或临床，而是两者兼备。虽然现在的医学教育体系已经为临床输送了大量具有临床科研复合型潜质的医生，但并不意味着每个人都能成为优秀的科研型医生。这需要他们不断自我培养，提升科研能力。 𐟓š 如何培养科研能力？读大量文献积累科研知识培养团队精神培养科研诚信和“以人为本”的职业道德尽管如此，还是有很多医生对科研持抗拒态度。因为他们一开始把重心放在临床，等后面再想做科研时，发现力不从心，迟迟没有结果。在当前的医疗环境下，不做科研，想有很好的发展是非常困难的。 𐟔 科研型医生的必备技能科研型医生需要掌握一些热门的研究方法，例如生信分析。生信分析可以快速处理和分析大量的数据，节省时间和精力。相比传统的实验方法，生信分析可以更高效地探索研究问题。在SCI论文中，使用生信分析可以增加研究的可信度和科学性。 𐟒𛠧”Ÿ信常用数据库 TCGA（The Cancer Genome Atlas）数据库：收录了常见33种癌症的20000多个样本的多种数据，是目前最大的癌症基因数据库。 GEO（Gene Expression Omnibus）基因表达综合数据库：GEO数据库最有价值的部分是存储了大量芯片数据，包括原始数据和处理后数据。GEO数据库的数据类型有9种，以芯片为主，例如RNA、甲基化和SNP芯片数据等。也包括很多高通量测序数据。 𐟌𑠥Œ𛧔Ÿ的未来对于那些希望在医学领域脱颖而出的医生来说，做科研宜早不宜迟。通过不断学习和实践，他们将能够在临床和科研两个方面都取得卓越的成就。

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𐟓Š 生信分析中的Meta技巧 𐟧젧”Ÿ信分析，你get了吗？来看看我们的meta分析服务吧！我们提供一站式指导，从选题到SCI论文发表，全程护航。𐟚€ 𐟔 无论你需要下载、处理GEO数据集，还是进行多个GEO数据集的去批次分析，我们都能轻松搞定。𐟒𛊊𐟓ˆ 想要可视化你的数据？没问题！热图、火山图、生存曲线等，你想看的我们都有。个性化展示，让你的数据更出彩！✨ 𐟔젔CGA表达差异分析、免疫浸润分析，我们样样精通。G0分析、KEGG分析，助你深入挖掘数据内涵。𐟧튊𐟒ᠨ😥œ觭‰什么？快来体验我们的生信分析meta分析服务吧！让你的研究更上一层楼！𐟌Ÿ

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