纯生信期刊2022年下载_纯生延产(2024年12月最新版)
11模型征服SCI!可解释性创新 机器学习算法的创新一直是科研人员努力攻克的关键点,尤其是可解释性。想象一下,如果机器学习模型不再是一个难以捉摸的“黑盒子”,而是能够清晰地解释其预测逻辑和决策依据,那将为科研和实际应用带来多大的便利和可能性。苏州大学附属儿童医院的李艳红教授团队成功将可解释性融入机器学习算法中,建立并验证了一个能够精准预测儿童急性肾损伤风险的模型。全文纯生信0实验,如何征服SCI医学1区Top期刊?以下是几条创新点总结: 构建11个机器学习模型并比较性能 通过构建11个不同的机器学习模型,团队比较了它们的性能,最终确定了最优模型。 减少特征数量 团队发现,只需8个特征就能构建出最优模型,这大大减少了计算复杂性和过拟合的风险。 模型验证 该模型在内部验证集和外部验证集中均表现优异,显示了其良好的泛化能力。 提高可解释性 利用SHAP方法,团队提高了模型的可解释性,使得模型预测的逻辑和依据更加清晰。 研究背景 急性肾损伤(AKI)是儿科重症监护病房(PICU)常见的严重器官功能障碍,早期识别和预测对于改善患儿预后至关重要。然而,当前的AKI诊断标准在敏感性和特异性方面存在不足,同时AKI的异质性也限制了生物标志物的临床价值。因此,研究旨在利用机器学习(ML)方法,建立并验证一个可解释的AKI预测模型,以改善AKI的早期识别,进而评估其对儿科重症监护病房儿童预后的影响。 数据来源 研究推导队列包括2020年9月至2021年1月在四个独立PICU住院的957名儿童,被分开进行训练和内部验证,并使用2021年2月至2022年2月入院的866名儿童的外部数据集进行外部验证。 研究思路 通过收集不同时间段的PICU儿童数据,利用易于获取的医疗特征,比较多种ML算法的预测性能,筛选出最优模型。随后,通过SHAP方法解释模型特征重要性,确定概率阈值,并结合KDIGO标准评估模型在不同亚组中的预后意义。 主要结果 模型开发和性能比较 最终模型 最终模型的外部验证 模型解释 预后影响 小结 本文构建了一个可解释的机器学习模型,专门用于预测危重儿童AKI的风险,同时深入探讨了模型预测结果对患儿预后的影响。这一创新性的模型不仅具备出色的预测性能,更重要的是突破了传统机器学习模型解释性差的局限,提供了全局和局部两种解释方式,增强了模型的可信度和可接受度。
如何轻松发表SCI论文?实用技巧分享 䚧瑧 小伙伴都问我,如何才能不断产出SCI论文。其实,只要掌握一些小技巧,发表SCI论文并不难。但首先,我要强调的是,灌水论文虽然可能,但过多灌水对未来的科研生涯并无益处。 科研品味低并不意味着不能发表高质量的论文。事实上,只要方法得当,一年发表10篇SCI论文也不是不可能。下面,我就来分享一些实用的灌水技巧,帮助大家轻松发表文章。 更换研究对象 将复杂问题简单化是关键。X是暴露因素,Y是结局因素,Z是研究人群。发SCI论文最重要的是创新,但事实上,只需要做出一点点创新就足以发表在一般的SCI期刊上。 ✅ 例如:2014年发表的文章,X是血铅,Y是骨密度,Z是中国人; ✅ 2022年用NHANES数据发表的文章,把Z换成美国女性; ✅ 还有NHANES数据的其他版本,把Z换成美国儿童和青少年、老年人、绝经女性等。 思路要开阔,不仅临床文章可以用这种方法,基础类或生信文章也同样适用。简单更换元素就能为文章增加一点点创新。 由于篇幅有限,这里先分享到这里。更多灌水技巧,我们下期再继续介绍。希望大家都能通过这些方法,轻松发表自己的SCI论文!
生信分析入门:6个基础步骤详解 《生信分析入门》带你从零开始,掌握生信分析的6个基础步骤: 1️⃣ 数据下载与预处理 2️⃣ 筛选疾病相关的差异表达分子 3️⃣ 基因注释与功能分类 4️⃣ 从差异表达分子中筛选关键基因 5️⃣ 构建关键基因与临床特征/预后的关联 6️⃣ 验证关键基因的临床意义 通过结合实例学习,推荐文章《基于生物信息学分析筛选卵巢癌预后相关的核心基因》,该文章于2022年发表在《临床与实验病理学杂志》上。通过对生信类文献的解读,可以理出生信分析文章的大致思路:通过数据库筛选出关键分子,最后通过少量的实验验证得出结论。 砦訍一些生信分析在线工具: 【常用的基因表达数据库】:GEO、TCGA 【常见的TCGA数据挖掘可视化网站】:cBioPortal、GEPIA、UALCAN 【差异表达分析工具】:GEO2R 【功能富集分析工具】:GSEA、DAVID、KEGG 【网络图构建工具】:STRING、cytoscape 通过这些工具,你可以更高效地进行生信分析。
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